从宏基因组学切入探讨阴道微生态
宏基因组( Metagenome)
宏基因组是一种不依赖于培养而对某一特定环境或生物群体内所有遗传信息进行综合分析和利用的技术。
通过提取微生物群体总DNA、构建宏基因组文库、测定和分析核酸序列以及筛选鉴定功能基因等过程, 探索自然界微生物的多样性、种群结构、功能活性、进化方式以及与环境之间相互作用的关系，可有效弥补传统培养法可能产生的结果偏差。
阴道菌群非常复杂，常见菌种估计超过500种。以往通过传统的培养方法研究阴道微生物菌群只能检测10余种病菌，会丢失部分不适合在该条件下生长的菌种，不能全面地反映阴道菌群的构成，窥测地筛查出个别致病菌，难以反映整体性病变状况。
传统的菌群检测方法存在如下四方面的缺陷:
①菌群种类太多，迄今大多数菌种仍未培养成功；②因不同菌种的培养条件与生长速度差异悬殊，经常规分离培养方法得到的结果未能真实反应其原生态状况;③耗费太大、耗时太长;
④因微生物本身致病性极易改变、微生物之间容易传递致病基因，故常规培养方法分离菌株的致病特性也难以体现其原生态状况。
上述种种缺陷，严重阻碍了常规微生物培养分离方法，对诸如口腔、肠道、阴道等复杂菌群的深入研究。
宏基因组则是针对上述缺陷的革命性技术进步。
直接从阴道分泌物中获得的微生物基因组的总和，包括乳酸杆菌基因组、大肠埃希基因组、葡萄球菌基因组、链球菌基因组等数百种微生物基因组的总和。微生物群落的基因组特征，使人们的认识从单一基因组上升到成千上万种基因组构成的集合体，使人们揭示更高层次更为复杂相互作用的梦想成为了现实。人们对阴道微生态菌群的认识取得了突破性的进展。
我国育龄期健康女性阴道内菌种较单一，而且均以乳酸杆菌占优势，每个样本仅有1~2种，且以一个优势菌种的居多。这可能是由于不同菌种之间的竞争性排斥作用，某一菌种的优先定植等作用决定的。但也有研究显示育龄健康女性中同时有3~4种乳杆菌定植的现象,目前机制尚不清楚。
阴道常见乳杆菌
卷曲乳杆菌：
卷曲乳杆菌在健康女性阴道呈高相对丰度存在。Jespers等研究显示,卷曲乳杆菌在健康阴道环境数量大于108 CFU/mL,且比较稳定。
加氏乳杆菌：
加氏乳杆菌是健康女性阴道菌群的常见乳杆菌之一。该菌通过产生乳酸、过氧化氢和细菌素等抑制病原菌定植。
詹氏乳杆菌：
也是健康女性阴道常见乳杆菌之一,擅长产生乳酸和过氧化氢等物质。与卷曲乳杆菌和加氏乳杆菌等相似,詹氏乳杆菌也表现出了良好的抑菌抗菌作用。
惰性乳杆菌：
惰性乳杆菌的发现较晚,是以往通过传统培养方法尚未认识到的阴道优势菌种。首次被鉴定是在2002年采用分子生物学手段检测出的。惰性乳杆菌是基因组最小的乳杆菌。
与卷曲乳杆菌等其他常见菌不同的是,惰性乳杆菌在无临床症状的健康个体和BV患病个体都经常被检测出,在患BV的女性阴道呈高水平存在。因此,有人认为惰性乳杆菌的增多与亚健康状态有关。
