生物信息学——核酸或蛋白质序列分析的一些软件

首先是行业标准的ARB软件
http://www.arb-home.de/home.html
支持Linux/Unix，MacOS系统
慕尼黑工业大学的研究人员开发
第二类是高通量测序结果的分析软件
MEGAN
http://ab.inf.uni-tuebingen.de/software/megan/
支持Windows, Linux/Unix, MacOS系统
Mothur（这个我用过）
http://www.mothur.org/wiki/Main_Page
支持Windows, Linux/Unix, MacOS系统（命令行操作）
作者是密歇根大学的Dr. Patrick Schloss
第三个是构建进化树的软件
RAxML
http://sourceforge.net/projects/raxmlgui/?source=dlp
需要安装python www.python.org/
使用教程：http://sco.h-its.org/exelixis/hands-On.html
支持Windows，Linux/Unix，MacOS系统
作者是德国慕尼黑大学的 A. Stamatak 博士
还有一个Bio-Linux 集成了大量生物信息学软件的操作系统
http://nebc.nerc.ac.uk/tools/bio-linux/package-list
生物信息学常用软件下载地址：
http://sourceforge.net/directory/science-engineering/bioinformatics/os:linux/freshness:recently-updated/
用Perl语言处理生物信息的工具：
http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page
生物信息学领域的软件更新很快，层出不穷，选择几个自己比较喜欢，结果符合标准的软件很重要，术业有专攻，才能走得更远。